中国最高科学研究机构是中国科学院,总部位于北京市海淀区。中国科学院是中国的最高学术机构和最高科学技术咨询机构,下设多个研究所和研究中心,涵盖了各个领域的科学研究。海淀区也是北京市科技创新的核心区域,聚集了众多高校和科研机构,是中国科学院总部所在地也就不足为奇了。